生物菌肥是以微生物的生命活動導致作物得到特定肥料效應的一種制品，是農業生產中使用肥料的一種，微生物肥料是活體肥料，它的作用主要靠它含有的大量有益微生物的生命活動來完成。
1、環保增質。克服了單施化學肥料造成土壤理化性狀退化和農產品質量下降的缺點。
2、“活”字當頭。它是以“活”的微生物作用為主導,向植物提供養分和協調土壤中各種礦物元素的釋放。
3、均衡調節。 根據土壤實際情況調節供應植物生長所需的氮磷鉀及多種微量元素。
4、舒經活絡。豐富的有機質可以改良土壤物理性狀，改善土壤團粒結構，從而使土壤疏松，減少土壤板結，增加了耕層土壤有機質，提高土壤肥力，改善農產品品質。
5、集優去差。 增加了耕層土壤“有益微生物菌群”，廣泛占領土壤微生物區域，壓縮甚至消滅害菌群的活動區域，從而長久發揮有益作用。
6、強身體健。微妙軍團菌肥可在植物根部大量生長、繁殖，從而形成優勢菌群，優勢菌群形成局部優勢，這樣就能抑制和減少病原菌的入侵和繁殖機會，從而提高植物抗逆性，能很好的減少病蟲害的發生，從而起到增產增收的效果。
7、物超所值。與施用其他肥料相比，性價比優，能省化肥、省農藥、省工省時，施后作物少殘留，“口感”、“看相”、“賣相”大增，商品率提高，賣價好，經濟效益翻番。
8、量小而精。與有機肥的施用相比，克服了體積大運輸不便的缺點，省時省工，施用方便。
9、安全簡單。與單施化肥相比，不存在由于濃度高而造成燒苗，或土壤鹽分高抑制植物生長的現象
10、通過有益菌的大量繁殖，大量有益菌在植物的根系周圍形成了優勢種群，抑制了其他有害菌的生命活動
11、快速分解土壤有機物質，促進土壤團粒的形成，且通過有益菌的活動能夠疏松土壤，土壤的保肥、供肥、保水、供水及透氣性都得到很好的調節。
12、分解土壤中的農藥殘留，避免殘留農藥對下季作物產生藥害。還對植物生長過程通過根系排放的有害物質進行分解。
13、固氮、解磷、解鉀功能。能夠部分利用空氣中的氮，通過有益菌生長代謝產生相應的酶和酸，固氮、解磷、解鉀功能。
14、能夠部分利用空氣中的氮，通過有益菌生長代謝產生相應的酶和酸，從而成為植物所能吸收的磷鉀肥。因此能夠大大提高作物對肥料的利用率，從而減少肥料的施用。
15、提高作物品質。解磷、解鉀的同時，能夠促使土壤中微量元素的釋放，被作物所利用，同時有益菌代謝產生多種植物所需的物質，如小分子氨基酸、生長刺激物質、維生素等促進作物早熟和延長采收期。
16、由于土壤理化性質得到改善，土壤養分豐富且平衡，土壤中肥料能夠更好的被作物很好的吸收，因此能夠促進作物早熟和延長采收期。
17、和有機肥配合使用，能夠持續不斷的改良土壤。2-3年就可使土壤完全達到生產有機作物的標準，且因為有益菌能夠快速分解有機物質為作物吸收，所以克服了有機肥料肥效慢的特點，單施有機肥產量低的特點。
18、安全簡單。與單施化肥相比，不存在由于濃度高而造成燒苗，或土壤鹽分高抑制植物生長的現象。
19、調節土壤酸堿度。一般肥沃的土壤ph值都在6-7之間，適宜的土壤酸堿度有利于植物生長。